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PCR引物要素基本要求
日期:2024-11-22 12:26
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摘要:
PCR引物要素基本要求:
1、引物長度: 15-30bp,常用為20bp左右。
2、引物擴增跨度: 以200-500bp為宜,特定條件下可擴增長至10kb的片段。
3、引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。
4、避免引物內部出現(xiàn)二級結構,避免兩條引物間互補,特別是3'端的互補,否則會形成引物二聚體,產生非特異的擴增條帶。
5、引物3'端的堿基,特別是末及倒數(shù)第2個堿基,應嚴格要求配對,以避免因末端堿基不配對而導致PCR失敗。
6、引物中...
PCR引物要素基本要求:
1、引物長度: 15-30bp,常用為20bp左右。
2、引物擴增跨度: 以200-500bp為宜,特定條件下可擴增長至10kb的片段。
3、引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴增效果不佳,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC隨機分布,避免5個以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列。
4、避免引物內部出現(xiàn)二級結構,避免兩條引物間互補,特別是3'端的互補,否則會形成引物二聚體,產生非特異的擴增條帶。
5、引物3'端的堿基,特別是末及倒數(shù)第2個堿基,應嚴格要求配對,以避免因末端堿基不配對而導致PCR失敗。
6、引物中有或能加上合適的酶切位點, 被擴增的靶序列有適宜的酶切位點, 這對酶切分析或分子克隆很有好處。
7、引物的特異性:引物應與核酸序列數(shù)據(jù)庫的其它序列無明顯同源性。
引物量:每條引物的濃度0.1~1umol或10~100pmol,以低引物量產生所需要的結果為好,引物濃度偏高會引起錯配和非特異性擴增,且可增加引物之間形成二聚體的機會。